Conjunto de métodos que mediante reacciones químicas permiten poner de manifiesto moléculas en un tejido para poder determinar en él su presencia y distribución, obteniendo un producto final coloreado y que puede ser visualizado al microscopio óptico. La histoquímica es ampliamente utilizada para demostrar presencia de microorganismos (como bacterias y hongos) y sustancias de depósito como el glicógeno, amiloide, lípidos y pigmentos, entre otros.